Roches et fossiles racontent l'histoire aquatique de la Touraine au temps où, il y a plusieurs millions d'années, des mers chaudes la recouvraient avant de se retirer en y déposant tuffeau et faluns et de laisser derrière elles le fleuve Loire.

Une présentation d'animaux naturalisés de la région nous rappelle qu'aujourd'hui castor et ragondin, héron et cormoran, alose et lamproie sont ici chez eux, en Touraine !

Au 1er étage du Muséum, les animaux du monde s'exposent.
Les quatre continents sont représentés : Océanie, Asie, Afrique, ainsi que les Amériques. Le continent européen est présent au 2ème étage. Dans cette salle, les animaux naturalisés (lion, gorille, oiseaux…) côtoient les animaux vivants (fourmis, reptiles, poissons et même un perroquet !). Une collection d'insectes est également mise à l'honneur avec la présentation de papillons et autres coléoptères du monde entier.