Comme nombre de grands cabinets de curiosités, le Muséum de Rouen s’implante en 1828 dans le Couvent des Visitandines, construit en 1640 et confisqué au clergé lors de la Révolution Française. À cette époque s’y installent également l’École départementale d’agriculture, le musée des Antiquités (1831), le musée de la Céramique (1864) et l’École régionale des Beaux-Arts.

Il ne reste aujourd’hui dans ce bâtiment que le Musée départemental des Antiquités au rez-de-chaussée et le Muséum d'histoire naturelle dans les étages. D’abord destiné aux étudiants en médecine pour illustrer les cours de zoologie, de botanique et de pharmacie, le Muséum de Rouen s’ouvre au public en 1834. Aujourd’hui, le Muséum conserve près de 800 000 objets dans tous les domaines scientifiques, le situant comme l'un des premiers établissements de ce genre en province pour la richesse et la diversité de ses collections (enquête du ministère de l’enseignement supérieur et de la recherche en 2000).